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SNP檢測(taqMAN探針法)


SNP(single nucleotide polymorphism)單核苷酸多態性。是指基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態性,在群體中的發生頻率不小于1%。SNP包括單個堿基的轉換、顛換、插入和缺失等,分布比較廣泛,有數據顯示占所有已知多態性的90%以上。SNP作是繼RFLP (限制性片段長度多態性)和小衛星DNA重復序列、微衛星DNA重復序列后的第三代DNA水平遺傳多態性標記。

SNP現已廣泛應用于基因組分析、生物信息自動化檢測、簡單和復雜疾病的遺傳研究及全球種族遺傳學研究等。

技術特點

■ 密度高 SNP在人類基因組的平均密度估計為1\1000bp,在整個基因組的分布達3×106個,遺傳距離為2~3cM,密度比微衛星標記更高,可以在任何一個待研究基因的內部或附近提供一系列標記

■ 遺傳穩定性 與微衛星等重復序列多態性標記相比,SNP具有更高的遺傳穩定性

■ 易實現分析的自動化 SNP標記在人群中只有兩種等位型(allele)。這樣在檢測時只需一個“+\-”或“全\無”的方式,而無須象檢測限制性片段長度多態性,微衛星那樣對片段的長度做出測量,這使得基于SNP的檢測分析方法易實現自動化 

TaqMan探針法

即利用定量PCR原理,在PCR 反應系統中加入兩種不同熒光標記的探針,它們可分別與兩個等位基因完全配對。正常情況下,由于探針5′端熒光基團和3′端淬滅基團緊鄰在一起,熒光被淬滅。隨著PCR 的有效進行,與模板完全配對的探針逐步被Taq DNA 聚合酶5′→3′外切酶活性切割,致使探針5′端上的熒光基團與3′端的淬滅基團分離,淬滅效應解除,報告熒光基團被激活;而與模板不能完全配對的探針(代表另一種等位基因)不能被有效切割,故檢測不到熒光信號,通過相應儀器檢測熒光值的變化即可實現SNP位點檢測。

SNP送測訂單及注意事項

請提供血液、組織或DNA樣品,及提供準確的基因名稱(基因ID)、序列和詳細的SNP位點RS號信息。

我們不接受有致病性的樣品。如果您的樣品帶有致病性,請您提供給我們基因組DNA,并將其進行加熱處理以殺死致病原體。請您確認樣品無致病性后在下一欄中簽名。
要求您提供的基因組DNA:樣品濃度不低于20 ng/ul,總體積不少于20 ul。
血液用EDTA抗凝劑的真空管采集或枸椽酸鈉抗凝,采集后放入-20度冰箱保存(最好-80℃保存),體積大于1ml。組織最好是新鮮(-80℃保存)或石蠟包埋的組織,也可以是95%乙醇中固定的組織,組織量大于10mg。樣品-70℃郵寄至本公司(干冰或液氮運送)以保證樣品質量。 

 


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