1常規3730測序
公司采用全新的3730XL測序儀,可以高自動化操作,2小時左右即可達到測序要求;液體分離膠使讀序長度達1100bp,精確讀長達800bp。利用Seqence5.2新型堿基識別與質量評分軟件,測序準確性有了極大的提高;電泳溫度可達70C,有效去除二級結構的影響;雙色激光兩側同時激發,使得靈敏度極高,熒光信號強度高度均勻,提高了測序模板DNA的濃度的適應范圍并且能進行超速測序。
公司測序特點及優勢
高素質測序隊伍:測序人員都是經過了嚴格培訓;熟練掌握所有測序儀器和測序相關實驗,認真負責的工作態度,絕不把實驗交給實習生,保證差錯率做到最小甚至杜絕!
測序速度快:菌和PCR未純化收到樣品后36小時內出結果;質粒和PCR已純化24小時出結果。
價格合理: 根據不同樣品定出不同價格,有價可以測,有樣品就可以測,用最優惠最合理的價格充分配合你的實驗和經費。
困難模板服務:高GC,發夾結構,POLY結構等,根據不同模板做出不同測序方案,量身定做,使你在測序中節省更多時間,實驗順利進行。
保密性強:交給我們東西無原則絕對保密。
測序收費約定:
現象描述 |
可能原因 |
是否收費 |
菌培養不好或失敗 |
挑克隆有誤,菌污染,訂單提供信息有誤 |
否 |
質粒抽提不成功 |
質粒太大或活化方式不好、轉化不好、拷貝數低、培養方式不當 |
否 |
測序無信號、信號弱 |
引物與模板結合不好(引物或模板原因) |
否 |
鑒定質粒或PCR濃度低,取消實驗 |
建議PCR(20ul) 、質粒(30ul)去離子水溶解 |
否 |
設計引物和序列拼接 |
大片段測序 |
否 |
抽提出質粒但測序不成功 |
引物與模板結合不好(引物或模板原因) |
否 |
測序雜峰 |
引物不純,模板不純 |
是 |
信號中斷或衰減 |
高級結構,GC rich,重復序列。 |
是 |
測序雙峰 |
非單克隆、雜合子、引物特異性差、重復序列、Poly(A/T/G/C)結構、PCR非特異性擴增 |
是 |
空載體 |
插入失敗,培養過程中片段丟失 |
是 |
客戶提供引物導致結果不理想 |
引物不純,引物不合適測序 |
是 |
PCR原液純化后但測序不成功 |
引物與模板結合不好(引物或模板原因) |
收純化費,不收測序費 |
測序收費價格(參考)
類型 |
價格 |
3730測序(5000-1w以上反應) |
14元/反應 |
3730測序(1000-4999反應) |
16元/反應 |
3730測序(1000以下,不低于96個/批) |
18元/反應 |
3730測序(批量樣品>48個) |
20元/反應 |
3730測序(零散樣品,小于48個) |
25元/反應 |
PCR純化 |
5元/反應 |
引物合成 |
1.3/bp |
測序樣品要求
PCR原液:片斷通常大于200bp;提供濃度大于50ng/ul,體積大于50ul;2ul電泳檢測主帶清晰。
PCR已純化:PCR產物溶于超純水中;濃度大于30ng/ul,體積大于20ul;電泳檢測條帶單一。
質粒 :質粒濃度大于100ng/ul,體積大于20ul;大質粒需要注明載體長度。
菌液模板要求:說明載體的抗性,我們提供Amp 、kan、chl、tet四種抗生素;
于低拷貝質粒請直接提供1ug純化質粒;
提供1ml左右的過夜培養菌液,于離心管中封口保存,防止交叉污染或泄漏,特別是熱天路遠的最好加15%的甘油,這樣處理一下以免菌死掉。
建議盡量提供穿刺培養的菌種,或用新鮮的菌裝到冰盒里運輸
引物要求:濃度大于3.2umol/l,體積大于20ul;
隨機引物、兼并引物或堿基長度大于30bp不適合測序;
盡可能提供引物全序列,PCR退火溫度;.
T7、SP6、M13(+)、M13(-)、T3等通用引物我們免費提供。
樣品類型及注意事項
樣品類型 |
收樣標準 |
注意事項 |
菌 |
500-1000ul新鮮菌液 |
可以提供5ml菌液或沉淀菌體直接提取質粒 |
質粒 |
濃度要求大于100ng/ul,大于20ul(反應個數多相應增加) |
建議送前鑒定濃度。建議不要溶于TE,要溶于超純水。因為TE離子濃度很高,抑制測序反應,建議純化后溶于15-20ul超純水中 |
PCR已純化 |
濃度要求大于50ng/ul,20ul左右(反應個數多相應增加) |
建議送前鑒定濃度。請注意我處是取2ul原液用1%瓊脂糖膠鑒定,客戶經常會取5ul鑒定。建議純化后溶于15-20ul超純水中 |
PCR未純化 |
濃度要求大于50ng/ul,大于50ul(不宜分離相差小于150BP的多個片段) |
建議送前鑒定濃度。請注意我處是取2ul原液用1%瓊脂糖膠鑒定,客戶經常會取5ul鑒定。如濃度過低我們會直接停止實驗,通知客戶重供樣。 |